A principios del siglo XVIII, la provincia de “Santa María la Antigua del Darién” se encontró en un estado de total decadencia y la ciudad que prestó el nombre a la provincia ya había desaparecido. En la costa atlántica, los escoceses fundaron una colonia de corta vida en 1700, y los indios cuna vivían en una total independencia, involucrados tanto en acciones hóstiles como en el comercio ilícito. Entre ellos vivía también un número de colonos franceses en una fragil alianza con grupos indígenas. Los españoles también trataron de formar alianzas con grupos indígenas importantes. Aunque tenemos algunos nombramientos de gobernadores (sujetos al gobernador de Panamá) ¹⁾ - en 1699 Miguel Cordones, en 1713 Sebastián de Castillo, en 1716 Antonio Luzcando -de ellos, solo Cordones dejó huella en la historia por el desalojo de los escoceses, pero parece que luego dejó su cargo inmediatamente (de los otros dos ni sabemos si fueron a Panamá). Era la familia Carrisoli cuyos miembros personificaron la presencia española en la provincia como “alcalde justicia mayor y capitán a guerra”. La provincia dependió en un todo de Panamá. Solo durante el mando del virrey Messía de la Cerda se creó una gobernación sólo sujeta a Panamá en lo militar - pero también entonces los nexos a Panamá eran estrechos y en 1783, solo hubo teniente de gobernador en Darién ²⁾. En todo momento, la provincia del Darién fue efectivamente una provincia en la costa del Pacífico, mientras que no había presencia en el Atlántico. Cuando sí se fundaron algunas fuertes y poblaciones en el Atlántico entre 1780 y 1790, fueron organizados y administrados exclusivamente desde Cartagena de Indias. Por esto, muchos documentos tardíos se refieren a la provincia como “Darién del sur”.